首先談到肺臟的特性，如同皮膚或者消化道向外開放的器官，因此常會有病菌，汙染的空氣，有害的香煙侵襲。如此對外界的刺激，肺臟如何反應已逐漸瞭解。尤其從前未注意的，新的免疫系統的細胞或者細胞激素（Cytocaine）的分子被發現。因此對氣喘的過敏性疾病，或者肺修補異常所發生肺纖維症，肺癌及COPD（Chronic obstructive pulmonary disease）等如何發生作用都逐漸瞭解。今後對外來的刺激，視肺部如何反應，以此為標的的藥物可能會研發出。也就是透過免疫反應或者組織修補反應的病態，肺以外的器官也可能發生，對這種治療的藥物不斷的在研究，有一天可以應用到肺的治療。但是最近推出的新藥，並不是對所有病患都有效，僅對一部份的病患顯示效果明顯。因此發生醫療的個人化， 即 Tailor-made medicine的醫療引起注意。其次談到藥物的副作用，如對肺癌使用的上皮增殖因子（EGF）受體tyrosine kinase inhibitor抑制劑，對肺癌的效果並不明顯，反而對一部份的病患產生很嚴重的副作用，因此有一段時間懷疑本劑的有效性。但是後來進一步研究，本劑對標的分子的EGF受體，也就是肺癌病患有EGF受體有異常時，會有80%病患對本劑的效果特別好。因為有這種情形，專家考慮是否可以活用到癌以外的病患。
對肺癌病患尋找特有的基因特變，並不是尋找身體全部的，或生殖細胞的基因特變，兩者是有若干不同。因此，如氣喘、COPD、肺纖維症，只檢查一種基因特變，再加以治療，實在是困難。但是目前對於遺傳因素與環境因素造成的疾病，也就是表現型（Phenotype），正在研發何種藥物能夠奏效。
談到呼吸道疾病，最重要的是如何減少曝露在香煙中。在這種情形下，不僅醫療單位，更重要的醫療政策單位得加倍努力。
對疾病的治療，對呼吸道疾病曾經是使用藥物治療。但心臟血管的治療是以插管（Intervention）為重要的治療。將來對呼吸道疾病的治療，插管也會變得很重要。支氣管鏡曾使用在支氣管狹窄部位，插入後再置放支架（Stent），或做對支氣管內的腫瘤雷射治療等，主要是外科疾病的治療。最近可以使用到氣喘或者COPD的治療使用氣管插管。對氣喘的治療使用支氣管的插管後使用Radio波燒灼，如此可以將支氣管增生的異常的平滑肌細胞消除，可抑制支氣管過度收縮。另一方面，防止肺過度收縮，將一部份的支氣管阻塞，並使其收縮。
其次談到再生治療或幹細胞治療，最大的困難，肺器官的構造是很複雜，曾使用組織工學的方法，試作再生治療。但肺要再生，其結構非常複雜，做一個肺部結構的架子（scaffold）都有困難，此方面有待加強研究中。如果要組織移值，會發生結構上架子的問題。相反的，細胞移植的研究也有進步。例如將人類胚胎幹細胞（ES細胞）分化為肺泡上皮細胞，送進老鼠的氣管內，可以抑制肺臟障礙的研究報告。另一種可能是投予間葉性幹細胞的方法，這種方法與其說組織再生，還不如說，利用間葉性幹細胞所產生的組織的修補因子，來修補呼吸道疾病，目前對COPD試用治療中。但是此類研究，究竟有多大的效果，現還不十分清楚。
另外談到增殖因子與修補因子，COPD是一種細胞會減少的疾病，因此曾使用 Retinoid acid的治療，但效果不理想。目前對修補因子Statin及增殖因子細胞激素(Cytocain)都在試用中。在服用Statin的病患不僅能夠降低膽固醇，同時使病情減輕的報告，因此本劑很可能有修補因子。據台灣的研究報告顯示，治療COPD，使用Statin有延年益壽的效果。
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