在消化道的表面散布各種色素，在使用內視鏡檢查時，不容易觀察到的消化道粘模的形態或者消化道機能得以使用色素內視鏡觀察到，可以說提升診斷功能，同時可以掌握病態。
其次談到食道與胃的色素內視鏡。食道的Lugol 氏碘液 (使用目前日本市面上出售的複方碘甘油（ Compound iodine glycerin），這種複方碘甘油含有甘油，粘性很高，因此不易染色，應去除甘油，使用碘化鉀（Potassium Iodide）與碘（Iodine)，配成適當的碘劑。使用內視鏡觀察食道時，先使用含5%Gascon溶液50C.C.洗淨食道壁的粘液或氣泡，然後仔細觀察食道內部，如果有問題時，在要拔除內視鏡時，將剛才準備的碘劑散布到食道，等20秒後觀察食道，同時要使用清水洗食道，如果染色不夠清楚，可以再加一點碘劑。檢查後為減少碘劑的副作用，要使用硫代硫酸钠（Sodium thiosulfate），稀釋4-5倍後沖洗。
其次談到使用Lugol 氏碘液檢查食道要注意事項：最重要的就是濃度的問題，通常使用碘的濃度為1%，如果使用2-3%的濃度，會有相當的刺激，使得病患檢查時很痛苦。用1%碘的濃度20 C.C.使用散布管散布到食道。如果使用的劑量不夠，可追加20 C.C.。注人完畢後，同時檢查食道，檢查完後將流入胃裡的碘劑吸出。檢查食道時，同時可檢查咽喉，檢查的時間是內視鏡插進去時，或者要拔出來時，尤其要觀察微小病變，使用肉眼很難看到，可使用窄頻影像系統(Narrow Band Imaging:NBI)觀察。檢查咽喉時不要使用碘劑，使用碘劑病患會很痛苦。
其次談到胃的靛胭脂(Indigo carmine) 為一種藍色染料。通常使用靛胭脂，市面上出售的是靛胭脂0.4%，20mg，5C.C.為1個小玻璃瓶(Ampoule)，使用時稀釋2-4倍使用，通常將靛胭脂0.4%，20mg， 5C.C.為1個小玻璃瓶(Ampoule)，使用20 C.C.的生理食鹽水稀釋，散布到胃後濃度會升高，但經一段時間後濃度又會降低，最好剛散布時觀察。使用的劑量為20 C.C. 散布到可疑部位，如果不夠，可以再追加20 C.C.。
最近使用的是醋酸靛胭脂（Acetic Acid Indigo carmine Dye），使用醋酸的目的，是因為內視鏡檢查時，通常要禁食，胃酸就不會分泌，投予醋酸後，因其刺激胃酸的分泌，這時胃的粘膜會一時的轉為白色，其維持時間約為1-3分鐘，如果有癌症，其部位會一時呈現白色，但很快就恢復正常。換句話說，正常粘膜與癌病變的粘膜可以分清楚。使用醋酸的濃度為1.5%，市面上出售食用醋的1/3濃度即可。使用的方法就是1.5%醋酸10 C.C.加上靛胭脂1 C.C.混合即可。使用過後應把留在胃裡的醋酸靛胭脂吸乾淨。
在市面上出售的Lugol 氏碘液，其說明書寫明，不到0.1%的人發生過敏反應。但是日本福島醫科大學小原勝敏教授，使用1%的碘製劑，只有病患發生胸口不舒服的感覺，並沒有嚴重的過敏反應發生。如果曾對碘過敏的病患，最好不要使用碘製劑。
其次再談到窄頻影像系統(Narrow Band Imaging:NBI)，對癌及其浸潤範圍的診斷，色素內視鏡的診斷，是有用，最近又研發出窄頻影像系統，可助色素內視鏡的診斷更加微細。NBI的檢查是利用窄頻的二種波長，青與綠，照射這二種光後，可以顯示粘膜表層的毛細血管及粘膜微細的變化，如此可以診斷微細的癌症變化。如果是食道癌，1 mm就可發現，但還要使用擴大內視鏡觀察。因為擴大內視鏡觀察，可以擴大到80倍。
最後談到色素內視鏡的展望，食道癌也好，胃癌也好，色素內視鏡可以早期發現，並發現其浸潤範圍，如果能夠配上NBI，會加強其診斷功能。
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