談到微生物的基因資訊（Genetic information）與抗生素抗藥性(Antimicrobial resistance: AMR)對策，其中抗菌藥抗藥性的問題為最大問題。其抗藥性會經過基因資訊水平讀取的時代已來臨。其在染色體有抗藥性基因及質體（Plasmid等，傳遞因子為基礎（Base），其傳遞從細菌株至細菌株，菌種至菌種，有多樣擴散情形。
談到染色體與Plasmid對抗藥性基因傳遞有何不同問題。很多醫師都知道，染色體發生抗藥性情形，因多種藥物刺激，細菌本身發生抗藥性突變為大部分，在某種菌種，成為克隆或複製（Clone）而傳播到全世界。關於成為很大問題的AMR，利用Plasmid，由菌種至菌種，整個移過去（Hebaton），如發生院內感染，處理起來，就會發生許多困難。也就是發生抗藥性，會發生水平感染。在這種情況下，可利用基因資訊，可以追蹤（Traceability）觀察。從追蹤觀察，可瞭解到細菌基因資訊變化速度。
日本主要使用結核菌，作為研究對象。在440萬鹽基中，在1年中，僅有0.5%部位發生突變，如此，可以細菌株與細菌株之間，及分離株與分離株之間，很容易分離出來。因此，可以將細菌暴發（Outbreak）疾病作為一種集團，或細菌混進去，而引起疾病，作為一種集團。
例如在醫院病房發生抗藥性細菌，並發生感染，要考慮，這種細菌在院內發生，或者從院外感染進來，固然要調查環境，但檢查基因資訊也很重要。現發現在院內感染發生複數菌種，如大腸菌及克留氏菌屬（Klebsiella），在院內發生有抗藥性感染，檢查發現，不同細菌帶有同一種Plasmid。因此，Plasmid排列順序，可以解讀這種為本國細菌，或國外入侵細菌。這種數據庫（Data base）正在形成。
談到基因資訊，可以應用到快速診斷。如果每位病患，要做細菌培養，可能要花數日時間。而現在可以使用快速診斷，檢查多種項目。基因資訊還可以觀察很多有關細菌從那裡來，往那個方向走，同時，可以判定抗藥性情形。如果分離菌株，能獲得基因資訊，同時也可獲得公共衛生，院內感染對策，及病患對抗生素使用注意事項，向病患建議都可能有幫助。
現已開始談到個別診斷，與基因資訊有密切關係，不久將來可以做到個別診斷。
目前可以做到是美國臨床實驗室標準化協會(Clinical and Laboratory Standard Institute：CLSI)或歐盟藥敏試驗標準（EUCAST）的最小抑菌濃度提煉(Minimum inhibitory concentration： MIC) 決定斷點( Breakpoint)。提案單位認為，現在要使用基因資訊預測，時間還早。如果數據庫能早充實，就可做到快速診斷。
目前對結核菌，多劑抗藥性，幾乎可以使用基因資訊，加以推測。現全世界都投入資訊解析工具的形式，加以研究，日本也參加會員之一。
現在有許多院內感染，食物中毒，都可利用基因資訊查出來。
美國食品藥物管理署（FDA）及疾病管制與預防中心（CDC）有 20萬株沙門氏菌、幽門螺旋桿菌等有關基因資訊，因此，如果暴發流行，很快就可查出，有問題細菌。美國已開始利用基因資訊檢查細菌，全世界，也將利用用這個個方法檢查細菌。
談到結核菌檢查，如果要做細菌培養，要花費很很多時間。如果能利用基因資訊的感度（ Sensitivity）和特異度（Specificity，現還沒有研究到那個地步。全世界在這方面加緊研究，如果這方面研究能夠充實，將來不必做細菌培養，利用基因資訊用就可查出細菌各種特性及抗生素抗藥性對策。
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關鍵字：基因資訊與抗生素抗藥性
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